جواد نکونام در نیمه دوم سال ۱۳۹۹ از استقلال جدا شد و بارها تاکید کرد این اتفاق بر خلاف میل باطنی او رخ داده. نکونام ۲۶ مرداد سال ۱۳۹۳ در مصاحبه‌ای با خبرورزشی برخی ناگفته‌ها پیرامون فضای استقلال از نگاه خود را مطرح کرد که بد نیست چکیده آن‌ها را مرور کنیم:

• بعضی افراد تا استقلال می‌بازد، حرف فنی ندارند و خیلی سریع می‌خواهند حواس مردم را پرت کنند.
• شما حرف از منش و پهلوانی نزنید که همه می‌دانند هر وقت از استقلال رفتید چه اتفاقاتی برای تیم رخ داد و چه بلاهایی سر مربیان بعدی آمد. می‌گویید من (نکونام) پهلوان نیستم که مصاحبه کرده‌ام اما چه زمانی آن روز فرا برسد که خیلی از مربیان و مدیران قبلی استقلال حرف بزنند و مشخص شود خود شما چقدر پهلوان هستید.
• حیف که دست آدم بزرگی همچون ناصر حجازی از این دنیا کوتاه است وگرنه می‌توانست جوابتان را به خوبی بدهد.
• مگر گواردیولا وقتی از بارسلونا با آن همه جام و افتخار رفت، برای بازگشتش به صورت خودجوش روز شمار گذاشتند؟ اصلا شما پهلوان هستید که طرفدارانتان به صورت خودجوش، بنر و پلاکارد روز شمارتان برای بازگشت به استقلال را دست می‌گیرند و به ورزشگاه می‌برند.